人民法院和人民檢察院是依據中國憲法設立的司法機關，分別依法獨立行使審判權和檢察權，不受行政機關、社會團體和個人的干涉。人民法院是國家的審判機關，依法承擔包括貪污賄賂瀆職等腐敗犯罪在內的各類刑事案件的審判工作，及時、公正地對檢察機關提起公訴的貪污賄賂瀆職等案件作出判決，依法懲治腐敗犯罪。人民檢察院是國家的法律監督機關，擔負著依法追究刑事犯罪、偵查國家工作人員貪污賄賂和瀆職侵權等職務犯罪、預防職務犯罪、代表國家向人民法院提起公訴等職能。最高人民法院、最高人民檢察院還通過司法解釋等方式，對貪污賄賂瀆職等腐敗案件的審判、檢察工作進行指導。人民檢察院、人民法院對偵查、審判案件過程中發現引發職務犯罪的重要問題，及時向有關部門和單位提出檢察建議和司法建議。
政府監察機關是依據中國憲法設立的行使監察職能的機關，依法對國家行政機關及其公務員和國家行政機關任命的其他人員，對法律、法規授權的具有公共事務管理職能的組織及其從事公務的人員，對國家行政機關依法委托從事公共事務管理活動的組織及其從事公務的人員執法、廉政、效能情況進行監察。
審計機關是依據中國憲法設立的審計監督機構，依法對國務院各部門和地方各級人民政府及其各部門的財政收支、國有金融機構和國有企業事業單位的財務收支等進行審計監督。中國還建立了經濟責任審計制度，對國家機關和依法屬于審計對象的其他單位主要負責人進行審計監督。
國家預防腐敗局是中國政府為統籌預防腐敗工作而專門設置的機構。其主要職責是：負責全國預防腐敗工作的組織協調、綜合規劃、政策制定、檢查指導，協調指導企業、事業單位、社會團體、中介機構和其他社會組織的防治腐敗工作，負責預防腐敗的國際合作和技術援助。
公安、金融等其他有關部門和機構，也在自身職責范圍內依法承擔反腐敗和廉政建設的相關工作。
上述具有不同職能的機構，在反腐倡廉各項工作中既相對獨立、各司其職，又相互協調、密切配合。中國共產黨的紀律檢查機關在掌握黨員違紀線索之后，經調查認定為違犯黨紀的，對其作出相應的黨紀處分；對其中涉嫌犯罪的，移送司法機關處理。政府監察機關對于違反政紀的監察對象，作出相應政紀處分；涉嫌犯罪的，移送司法機關處理。公安、審計、行政執法機關在履行職責過程中發現有違法違紀行為的，根據具體情況分別移送司法機關或黨的紀律檢查機關、政府監察機關處理。人民法院、人民檢察院在履行職責過程中發現犯罪嫌疑人涉嫌違犯黨紀或政紀的，將有關證據材料移送黨的紀律檢查機關或政府監察機關處理。
中國從事反腐敗工作的機構承擔著開展反腐敗和廉政建設、維護社會公平正義的重大責任。近年來，這些機構采取一系列措施，對執法執紀干部隊伍嚴格要求、嚴格教育、嚴格管理、嚴格監督，切實加強自身建設。通過加強內部管理和制度建設，完善制約監督機制，督促執法執紀人員秉公用權、嚴格自律；通過推行權力公開透明運行、廉政監督員等制度，督促執法執紀人員牢固樹立接受監督意識、自覺接受各方面監督，不斷提高執法執紀能力和水平，為中國的反腐敗和廉政建設提供組織保證。